Стоян Зинаида Андреевна. На должность директора избрана педагогическим коллективом.  Под её руководством с 1985 г. школа  работала над проблемой  гуманизации учебно-воспитательного процесса, а с 1992 г. вела опытно-экспериментальную деятельность по формированию максимально развитой личности, исходя из её способностей и возможностей в условиях школы-центра медико-социально-педагогической реабилитации детей и подростков.В школе создана система ученического самоуправления «Институт развития  творчества». И успешно работают три музея школы: Боевой Славы имени Героя  Советского Союза А.М. Зверева, Пионерской Славы Т. Савичевой, краеведческий «Сияние Севера».

С 1994 г. школа работает в двух зданиях в режиме односменных занятий.  В 2000 г. постановлением мэра муниципального образования г. Надым и Надымский район школа была зарегистрирована как юридическое лицо, а в 2003 г. получила лицензию на право осуществления образовательной деятельности. В последующий период школа дважды успешно прошла аттестацию и аккредитацию.

В 2007 году МОУ СОШ №2 г. Надыма стала победителем конкурса общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы в рамках реализации приоритетного национального проекта «ОБРАЗОВАНИЕ».